Cinquante années après sa création, l’Institut connaît des problèmes récurrents. Il s’agit entre autres du sous-équipement médico-chirurgical et pédagogique, de la vétusté du matériel impactant fortement sur la qualité de la formation et des soins, de la faible capacité d’accueil des étudiants et des patients, d’une insuffisance de locaux destinés aux personnels d’enseignement et de recherche, de difficultés d’approvisionnement en matière d’intrants médico-chirurgicaux, d’une absence de personnels d’appui hospitalier, l’absence d’un cadre hospitalier où toutes les spécialités odontologiques peuvent s’exercer. Ainsi, il importe de promouvoir l’Ios par son financement adéquat, à travers des ressources humaines de qualité et un plateau technique relevé pour permettre l’institut de mieux remplir ses missions et d’atteindre ainsi les standards internationaux en matière de formation odontologique et de soins dentaires. Le Professeur Henri Michel Benoist, réclame l’autonomisation de l’institut pour faire de lui une structure hospitalière universitaire. Il faut rappeler que l’Institut est rattaché depuis sa création à la Faculté de Médecine de l’Ucad.